碳青霉烯類抗菌藥物一直是產超廣譜β內酰胺 酶(ESBLs)或 AmpC 酶的腸桿菌科細菌治療首選藥 物,也被認為是最后的防線 。隨著該類抗菌藥物 的 廣 泛 使 用 ,臨 床 耐 碳 青 霉 烯 類 腸 桿 菌 科 細 菌 (CRE)菌株對碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥率逐年升 高,這在很大程度上限制了該類抗菌藥物的使用,造 成了藥物使用的困難 。
1 材料與方法
1. 1 菌株來源
收集 2018 年 1—12 月重慶市某三
甲醫院臨床分離的非重復腸桿菌科細菌1 202株。陽
性對照菌株為 5 株重慶醫科大學附屬兒童醫院分離
的碳青霉烯酶基因陽性肺炎克雷伯菌,包括 bla KPC-2、
bla IMP-1、bla VIM-2、bla NDM-1和 bla OXA-48 5 種基因型,陰性對
照菌株為實驗室保存的標準菌株大腸埃希菌 ATCC
25922。
1. 2 儀器與試劑
儀器:VITEK-MS 質譜儀和 VITEK-2 Compact 全自動微生物鑒定藥敏儀(均為法
國生物梅里埃公司生產),GNP29270 型恒溫培養箱
(上海精宏實驗室設備有限公司生產),CFX96 熒光
定量 PCR 擴增儀和 Bio-Rad ChemiDoc XRS 凝膠成
像系統(均為美國 Bio-Rad 公司生產),BG-subMIDIv)可見光電泳—透射儀(北京百晶公司生產)。試
劑:血瓊脂平皿購于英國 OXOID 公司,VITEK-MS
CHCA基質液購于法國生物梅里埃公司,Premix Taq?
酶和 DNA Marker 均購于大連寶生生物公司,5 種基
因的引物由重慶擎科興業生物技術有限公司合成。
1. 3 CRE 菌株鑒定及藥敏試驗
將 61 株 CRE 菌株
均經 VITEK-MS 質譜儀鑒定到種,再通過 VITEK-2
Compact 進行藥敏試驗,并用最小抑菌濃度(MIC)法
測定其對 14 種常用抗菌藥物的敏感性,參照 2018 版
CLSI-M100 標準判讀結果,本研究將對亞胺培南耐
藥的腸桿菌科細菌定義為 CRE,并對各種抗菌藥物
耐藥率進行數據分析。
1. 4 檢測 CRE 菌株的碳青霉烯酶基因
(1)模板
制備:CRE 菌株 DNA 采用煮沸法提取,放-20 ℃冰箱
保存備用。(2)碳青霉烯酶基因的 PCR 檢測:以 CRE
菌 株 DNA 為 模 板 分 別 對 bla KPC-2、bla IMP-1、bla VIM-2、
bla NDM-1 和 bla OXA-48 5 種基因型進行 PCR 擴增,反應
條件參照進行。PCR 反應體系
為 25 μL,包括 12. 5 μL Taq PCR Master Mix,2 μL 上
下游引物,1 μL DNA 模板,9. 5 μL ddH2O。PCR 反應
條件為先 94 ℃預變 5 min,再 94 ℃變性 30 s,55 ℃退
火 30 s,72 ℃延伸 30 s 或者 60 s(具體根據產物長度
而定);變性、退火、延伸 30 個循環;最后 72 ℃繼續延
伸 7 min。將 PCR 擴增產物置于 2. 0%瓊脂糖凝膠電
泳25 min,然后再通過凝膠成像儀觀察結果。(3)碳
青霉烯酶基因測序:將 PCR 擴增陽性的產物送深
圳華大生物技術有限公司進行測序,將測序所得
的序列與 GenBank 核酸數據庫進行 BLAST 序列比
對,將相似度最高的基因型作為待測細菌的基因
類型。
1. 5 統計學方法
采用 WHONET 5. 6 軟件進行統
計分析。
2 結 果
2. 1 CRE 菌株鑒定及藥敏試驗結果
采用 WHONET 5. 6 軟件對藥敏資料進行統計分析,分離得到61 株 CRE 菌株,其中肺炎克雷伯菌 51 株(83. 6%)、
陰溝腸桿菌 6 株(9. 8%)、大腸埃希菌 4 株(6. 6%),
61 株 CRE 菌株的科室及種類分布;同時,藥
敏結果顯示,61 株 CRE 菌株對 14 種抗生素的耐藥率
分別為亞胺培南(100. 0%),氨芐西林/舒巴坦(100. 0%),
頭孢曲松(100. 0%),頭孢他啶(100. 0%),頭孢替坦
(91. 5%),頭孢吡肟(93. 9%),哌拉西林/他唑巴坦
(91. 5%),氨曲南(95. 5%),復方新諾明(81. 3%),慶
大霉素(81. 3%),妥布霉素(73. 2%),環丙沙星(79. 3%),
左旋氧氟沙星(58. 5%),阿米卡星(57. 7%),61 株 CRE
菌株對臨床常用抗生素呈高度耐藥,除了對左旋氧
氟沙星和阿米卡星的耐藥率低于 60.0%,對大部分抗
生素的耐藥率都大于80.0%。
2. 2 碳青霉烯酶基因檢測結果
61 株 CRE 菌株中
共檢測出 bla KPC-2 基因型 50 株,bla NDM-1 基因型 9 株,
bla OXA-48基因型4株,未檢測出bla IMP-1基因型和bla VIM-2
基因型。
3 討 論
腸桿菌科細菌作為社區和院內感染的重要病原
菌,可引起呼吸道、尿路以及菌血癥等各種部位的感
染。碳青霉烯類抗菌藥物對大多數產超廣譜β內酰
胺酶和質粒介導的 AmpC 酶具有較高的穩定性,是
目前治療革蘭陰性菌抗菌譜最廣、抗菌活性最強的
一類抗菌藥物。但是隨著該類藥物大量使用甚至過
度治療,臨床耐藥現象已在腸桿菌科細菌中開始出
現,并呈逐年增加趨勢,且耐藥范圍已從歐洲、北美
等地區擴大到中國,菌種也擴展至多種不同種屬的
腸桿菌科細菌 。2018 年全院共
分離出 61 株 CRE 菌株,其中耐碳青霉烯類肺炎克雷
伯菌 51 株,占 83.6%,說明該院主要感染 CRE 菌株呈
優勢性病原菌感染流行趨勢,這與 CHINET 中國細
菌耐藥監測網統計結果基本一致。該情況仍值得
臨床密切關注并采取有效的控制措施,避免重復給
藥、超適應證給藥等錯誤行為的發生。
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